稀釋性曲線(rarefaction curve):一般是從樣本中隨機抽取一定數(shù)量的個體,統(tǒng)計出這些個體所代表物種數(shù)目,并以個體數(shù)與物種數(shù)來構建曲線。它可以用來比較測序數(shù)量不同的樣本物種的豐富度,也可以用來說明樣本的取樣大小是否合理。分析采用對優(yōu)化序列進行隨機抽樣的方法,以抽到的序列數(shù)與它們所能代表OTU的數(shù)目構建rarefaction curve。稀釋性曲線圖中,當曲線趨向平坦時,說明取樣的數(shù)量合理,更多的取樣只會產(chǎn)生少量新的OTU,反之則表明繼續(xù)取樣還可能產(chǎn)生較多新的OTU。因此,通過作稀釋性曲線,可以得出樣品的取樣深度情況。
稀釋性曲線分析結果
默認是在 97%相似性水平下劃分OUT并制作各樣品的稀疏曲線。
稀釋性曲線(rarefaction curve),首發(fā)于微基生物。
]]>