實(shí)時熒光定量PCR(RT-qPCR),首發(fā)于微基生物。
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原理
在PCR反應(yīng)體系中加入熒光基因,利用熒光信號累計(jì)實(shí)時監(jiān)測整個PCR進(jìn)程,最后通過標(biāo)準(zhǔn)曲線對未知模板進(jìn)行定量分析的方法。
特點(diǎn)
檢測儀器少,只用一臺儀器。
檢測時間短,只須45分鐘~1小時10分鐘(試劑各異),而定性PCR須3~4小時,酶免終點(diǎn)定量須6~8小時,熒光終點(diǎn)定量須2~3小時。
操作極其簡單:前處理后,樣本插入儀器一小時后到電腦上來出報告即可,無須開蓋,移樣本(以前方法),避免污染。
結(jié)果精確:定性PCR只能定性,很粗略,終點(diǎn)定量PCR由于只能在40個熱循環(huán)結(jié)束后檢測熒光,被測熒光達(dá)到飽和導(dǎo)致定量不夠精確,屬于半定量狀態(tài)。而實(shí)時熒光QPCR是在擴(kuò)增的每時每刻連續(xù)檢測各樣本的熒光值的變化。
應(yīng)用
基因擴(kuò)增、檢測、定量分析; 擴(kuò)增特異性分析;SNP分析;RFLP多態(tài)性分析;單/多基因表達(dá)研究;高通量基因表達(dá)譜研究。
微基生物其QPCR定量實(shí)驗(yàn)流程:
1. 標(biāo)準(zhǔn)曲線的制作
標(biāo)準(zhǔn)曲線利用含有qPCR目的片段的質(zhì)粒為標(biāo)準(zhǔn)基因,具體步驟如下:
(1) 選用克隆文庫中含有目標(biāo)基因質(zhì)粒的搖瓶培養(yǎng);
根據(jù)客戶需求,構(gòu)建標(biāo)準(zhǔn)質(zhì)粒(16S/18S/ITS/功能基因)
?。?)試劑盒提取質(zhì)粒;
?。?)測定質(zhì)粒濃度;
(4)對質(zhì)粒的拷貝數(shù)進(jìn)行計(jì)算;
?。?)將質(zhì)粒DNA進(jìn)行10倍梯度系列稀釋制作標(biāo)準(zhǔn)樣品和待測樣品一起擴(kuò)增,得出標(biāo)準(zhǔn)曲線;
(6)根據(jù)所得標(biāo)準(zhǔn)曲線計(jì)算出樣品中的基因拷貝數(shù),最后以基因拷貝數(shù)每μL為單位進(jìn)行分析。
2、熒光定量
?。?)本研究通過熒光定量的方法細(xì)菌16S rRNA基因進(jìn)行定量。引物選取->qPCR。
根據(jù)客戶需求設(shè)計(jì)的引物進(jìn)行實(shí)驗(yàn)
(2)PCR擴(kuò)增程序1
3、標(biāo)準(zhǔn)曲線繪制
4、樣品中拷貝數(shù)測定
實(shí)時熒光定量PCR(RT-qPCR),首發(fā)于微基生物。
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