標(biāo)簽歸檔：高通量測(cè)序

對(duì)16S rRNA基因進(jìn)行高通量測(cè)序時(shí)，往往會(huì)遇到測(cè)序區(qū)域選擇的問(wèn)題。16S rRNA基因包括9個(gè)高變區(qū)和9個(gè)保守區(qū)，選擇哪個(gè)區(qū)域呢？在本次的視頻中，跟大家探討一下測(cè)序區(qū)域選擇的問(wèn)題。

什么是高通量測(cè)序技術(shù)？它的優(yōu)勢(shì)有哪些？它的流程是什么？在本期的視頻中我們將為大家簡(jiǎn)單介紹下基于16SrRNA基因的高通量測(cè)序技術(shù)。

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基于Roche 454 、Illumina MiSeq、Ion Torrent PGM等高通量測(cè)序平臺(tái)，比如16S/18S/ITS等序列或功能基因，比如細(xì)菌和古菌的氨氧化酶基因、硫酸鹽還原菌的異化型亞硫酸鹽還原酶基因進(jìn)行測(cè)序分析，揭示環(huán)境樣品中眾多不同類型微生物種類以及它們之間的相對(duì)豐度和進(jìn)化關(guān)系。

18S rRNA基因普遍存在于真核細(xì)胞中，保守區(qū)與可變區(qū)在其上交替排列。其中，V4區(qū)使用最多、數(shù)據(jù)庫(kù)信息最全、分類效果最好，是18S rRNA基因分析真核微生物多樣性的最佳選擇。微基生物根據(jù)客戶需求，針對(duì)真核微生物18S rRNA基因的不同V區(qū)設(shè)計(jì)PCR引物，針對(duì)不同樣本開(kāi)展個(gè)性化分析