目前二代高通量測序已經(jīng)成為研究人體、動物、植物等菌群結(jié)構(gòu)常用的一種方法,該方法僅僅可以得到樣本中微生物的種類和相對豐度,而無法拿到具體菌株。
微基生物專注微生態(tài)研究和應(yīng)用,不僅具有二代高通量測序平臺,而且還建立了菌群需氧/厭氧分離培養(yǎng)平臺,為客戶提供高效的需氧/厭氧菌的非靶向分離培養(yǎng)服務(wù),幫助客戶獲得糞便、腸道、土壤、淤泥等樣本中大多數(shù)菌株。
可培養(yǎng)樣本
可培養(yǎng)糞便、腸道組織、土壤、淤泥、植物、藥品等樣本中微生物
樣本保存和運輸
在采樣之前,微基生物給客戶寄送厭氧或需氧保存液,客戶可將采集的新鮮樣本放入保存液匯中,寄回即可。
檢測流程:

1 首先通過二代高通量深度測序技術(shù),檢測樣本中微生物的種類及其相對豐度。
2 通過查閱文獻和資料,確定多種培養(yǎng)基和培養(yǎng)條件,盡可能多的培養(yǎng)純化菌株。
3 利用選定的培養(yǎng)基和培養(yǎng)條件,對樣本中的微生物進行培養(yǎng),同時利用96孔板進行大規(guī)模的分離、純化等反復(fù)操作,盡可能純化較多的菌株。
4 對最終純化好的菌株進行菌種鑒定,從基因水平上再次確認菌株的分類學(xué)屬性。
5 根據(jù)客戶的需求,對純化好的菌株進行擴繁培養(yǎng)。
菌群非靶向分離培養(yǎng)的實驗示意圖


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