通過高通量、PCR-DGGE方法僅僅可以檢測到樣本中微生物的種類和相對豐度,但無法拿到具體的菌株。通過厭氧或需要條件下的靶向分離培養(yǎng)技術(shù),可以獲得特定的菌株。
首先通過二代( Illumina)、三代高通量測序(PacBio)技術(shù)檢測樣本中微生物的種類及其相對豐度,確定樣本中是否有目標(biāo)微生物,在確定目標(biāo)微生物的相對豐度后,通過厭氧或需氧培養(yǎng)系統(tǒng)、不同配方的培養(yǎng)基進(jìn)行培養(yǎng)、分離、純化等操作,找到目標(biāo)菌株。對純化好的目標(biāo)菌株進(jìn)行高通量測序鑒定,從基因水平上確定目標(biāo)菌株。 具體流程:
技術(shù)平臺: 厭氧培養(yǎng)系統(tǒng)
二代高通量測序平臺

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