標(biāo)簽歸檔：16S rRNA

擴(kuò)增子測序是指利用PCR-DGGE、二代高通量測序、三代高通量測序等平臺對土壤、水體、糞便、腸道內(nèi)容物、唾液、皮膚等樣本中的16S rRNA基因/18S rRNA基因/ITS/功能基因等進(jìn)行檢測，檢測樣本中微生物的種類和相對豐度。

對16S rRNA基因進(jìn)行高通量測序時，往往會遇到測序區(qū)域選擇的問題。16S rRNA基因包括9個高變區(qū)和9個保守區(qū)，選擇哪個區(qū)域呢？在本次的視頻中，跟大家探討一下測序區(qū)域選擇的問題。

細(xì)菌的核糖體RNA（16S rRNA）普遍存在于原核細(xì)胞中，其含量較高、拷貝數(shù)較多，模板便于獲取，功能同源性高，遺傳信息量適中，適于作為細(xì)菌多樣性分析的標(biāo)準(zhǔn)。微基生物根據(jù)客戶需求，針對細(xì)菌16S rRNA基因的不同V區(qū)設(shè)計(jì)PCR引物，針對不同樣本開展個性化分析。

古細(xì)菌多生活在各種極端的生態(tài)環(huán)境中，它們代表了生命的極限，確定了生物圈的范圍。古細(xì)菌分為泉古菌、廣古菌、初古菌和納古菌。具有代表性的古細(xì)菌有極端嗜熱菌、極端噬鹽菌、極端嗜酸菌、產(chǎn)甲烷古菌、嗜熱菌、噬鹽菌等。