標(biāo)簽歸檔：rda

　做微生物多樣性研究時(shí)，大家是不是經(jīng)常會(huì)遇到RDA分析、CCA分析、PCA分析、PCoA分析呀？我們知道它們對(duì)物種（基因或功能）的分析具有重要的作用。但是你知道它們代表什么意思？在什么情況下用什么分析嗎？

　RDA 或者CCA定義是基于對(duì)應(yīng)分析發(fā)展而來(lái)的一種排序方法，將對(duì)應(yīng)分析與多元回歸分析相結(jié)合。此分析是主要用來(lái)反映菌群與環(huán)境因子之間關(guān)系。RDA是基于線性模型，CCA 是基于單峰模型。分析可以檢測(cè)環(huán)境因子、樣品、菌群三者之間的關(guān)系或者兩兩之間的關(guān)系。

RDA分析(Redundancy analysis) RDA分析，即冗余分析，對(duì)比主成分分析可以發(fā)現(xiàn)，其實(shí)冗余分析就是約束化的主成分分析。PCA和RDA的目的都是尋找新的變量來(lái)代替原來(lái)變量，它們主要區(qū)別在于后者樣方在排序圖中的坐標(biāo)是環(huán)境因子 …