厭氧/腸道菌分離培養(yǎng)

高效篩選、高通量測序、目標(biāo)菌株篩選、全流程化服務(wù)

 

服務(wù)簡介腸道微生物參與消化、吸收、免疫調(diào)節(jié)等多個(gè)生理過程。通過分離培養(yǎng)腸道微生物，可以深入了解腸道微生物群落的組成和功能，為疾病診斷、治療以及個(gè)性化營養(yǎng)方案的制定提供依據(jù)。

微基生物提供腸道菌群微需氧/厭氧、靶向/非靶向分離培養(yǎng)服務(wù)。結(jié)合高通量測序和培養(yǎng)技術(shù)，幫助客戶獲取盡可能多的菌株及特定目標(biāo)菌株。

服務(wù)亮點(diǎn)

高效篩選：采用多種培養(yǎng)基和培養(yǎng)條件，高通量培養(yǎng)組學(xué)顯著提高篩選效率。

高通量測序：結(jié)合二代高通量深度測序技術(shù)，提高微生物分離培養(yǎng)的效率和準(zhǔn)確性。

目標(biāo)菌株篩選：根據(jù)研究需求，靶向篩選具有特定功能及生物學(xué)分類的目標(biāo)菌株。

全流程化服務(wù)：從樣本檢測到菌株純化、鑒定及擴(kuò)繁，一站式解決客戶需求。

服務(wù)流程

1.樣本檢測

對原始樣本進(jìn)行二代高通量測序，檢測樣本中微生物的種類及其相對豐度。

2.培養(yǎng)條件確定

根據(jù)測序結(jié)果，確定目標(biāo)菌株的培養(yǎng)條件和培養(yǎng)基。

3.微生物培養(yǎng)與純化

利用選定的培養(yǎng)基和培養(yǎng)條件進(jìn)行培養(yǎng)，利用96孔板進(jìn)行大規(guī)模的分離和純化。

4.菌種鑒定

對最終純化好的菌株進(jìn)行基因水平的菌種鑒定，確認(rèn)菌株的分類學(xué)屬性。

5.功能驗(yàn)證

根據(jù)需要，對篩選出的目標(biāo)菌株進(jìn)行功能驗(yàn)證。

樣本類型

糞便樣本、腸道組織樣本、動物糞便樣本等。

樣本保存和寄送

采集新鮮糞便樣本后，立即放入厭氧活菌保存液中。盡快置于-80℃凍存。

所有樣本采集完成后，在冰盒中郵寄至檢測公司。

案例分享

案例1：Isolation and Cultivation of Human Gut Microorganisms: A Review.2023

文獻(xiàn)綜述了人類腸道微生物的分離和培養(yǎng)策略，重點(diǎn)介紹了培養(yǎng)組學(xué)的非靶向和靶向策略。非靶向策略通過在多種培養(yǎng)基上培養(yǎng)樣本，盡可能多地分離微生物；靶向策略則利用分子生物學(xué)、生物信息學(xué)等技術(shù)，針對特定微生物進(jìn)行分選和培養(yǎng)。

 案例2：比較健康志愿者配對的糞便和直腸活檢樣本的微生物特征（Comparison of microbial signatures between paired faecal and rectal biopsy samples from healthy volunteers using next-generation sequencing and culturomics.2022）

文獻(xiàn)研究通過比較健康志愿者配對的糞便和黏膜微生物群的特征，以驗(yàn)證糞便樣本是否可以作為直腸活檢相關(guān)微生物群的替代品。

樣本類型：健康志愿者的糞便和直腸活檢樣本。

研究方法：通過細(xì)菌培養(yǎng)和16S測序，比較糞便與直腸活檢樣本的微生物特征。

研究結(jié)果：配對糞便和直腸活檢清洗樣本的細(xì)菌特征非常相似，驗(yàn)證了糞便樣本作為直腸活檢相關(guān)微生物群的便捷替代品的用途。

不同糞便和直腸活檢樣本類型間微生物特征的比較  門/屬級別

糞便和直腸活檢沖洗樣品間的物種多樣性比較 

樣本間細(xì)菌培養(yǎng)與測序結(jié)果對比圖