鼻咽微生物

定殖于鼻咽部的微生物與人體始終處于動態(tài)生態(tài)平衡，對于維持人體健康發(fā)揮著重要作用，也與多種上呼吸道疾病的發(fā)生發(fā)展有密切關(guān)系。鼻咽部微生物之間及其與宿主之間的相互作用是引發(fā)人體上呼吸道疾病的重要因素。人體鼻咽部的密度只有104?105細胞數(shù)/cm。

基于16S rDNA/18S rDNA基因，優(yōu)化實驗方法，增加對痕量微生物的研究，利用二代測序（Next Generation Sequencing，NGS）技術(shù)（454 GS FLX，Illimina HiSeq、MiSeq）來分析鼻咽處微生物的多樣性，全面認識人體鼻咽部位微生物的多樣性及不同人群之間的差異性。

研究案例：

小孩子容易得呼吸性感染，且鼻咽部感染主要發(fā)生在秋天和冬天，因此Bogaert等對96個健康的小孩子的鼻咽部微生物進行分析，并比較秋天冬天與春天鼻咽部微生物群落的差異。研究發(fā)現(xiàn)鼻咽部共包括13個門，約250個種。其中5個主要門為Proteobacteria (64%)，F(xiàn)irmicutes (21%)，Bacteroidetes (11%)，Actinobacteria (3%) and Fusobacteria (1.4%) ，個體間微生物組成差異很大。不同季節(jié)鼻咽部微生物差異顯著不同，這些差異與抗生素的使用和病毒協(xié)同感染是沒有關(guān)系的。

Variability and Diversity of Nasopharyngeal Microbiota in Children: A Metagenomic Analysis. 2011. PLoS One.

研究區(qū)域：V5-V6區(qū)
測序平臺：Roche 454 GS FLX

主要結(jié)果：
50個來自秋冬季的鼻咽部微生物樣本和46個來自春季的鼻咽部微生物樣本的微生物組成模式圖。