新年福利第一波！干貨分享–NCBI下載基因序列

　　在微生物多樣性分析的研究中，我們經(jīng)常會(huì)尋找某個(gè)微生物或多個(gè)微生物的基因序列。你知道從哪里尋找嗎？找到后怎么down下來嗎？

　　小編跟大家分享一下尋找和下載基因序列的經(jīng)驗(yàn)！

　　我們以常用的NCBI為例，來給大家做個(gè)圖文介紹！

　　NCBI是一個(gè)強(qiáng)大的數(shù)據(jù)庫，也是生物學(xué)科經(jīng)常使用的搜索引擎，它收納了大量的基因序列。我們以大腸桿菌為例下載它的基因序列。

　　第一步，打開NCBI官方主頁

　　第二步，搜索大腸桿菌的序列。選擇Nucleotide數(shù)據(jù)庫，輸入大腸桿菌的拉丁名，記住一定是拉丁名！Escherichia coli?。ú恢览∶目梢匀フ叶饶铮┤缓簏c(diǎn)擊 Search

　　第三步，選擇我們需要的結(jié)果。數(shù)據(jù)庫會(huì)搜索出多個(gè)結(jié)果，通過甄別選出我們想要的序列1，對(duì)此進(jìn)行勾選

　　第四步，下載所選的基因序列。在右上角，點(diǎn)擊Send to 的黑色小三角，出現(xiàn)Choose Destination對(duì)話框，按照下圖進(jìn)行選擇，下載格式為FASTA的大腸桿菌序列

這就是我們下載的大腸桿菌的序列！

　　其實(shí)?NCBI還可以批量下載多個(gè)序列

　　要想批量下載基因序列，首先要拿到基因的“身份證號(hào)”！每個(gè)基因都有它“身份證號(hào)”Accession number，NM和GI

　　我們以5個(gè)基因序列為例，用NM和GI搜索下載基因序列。在NCBI的Nucleotide數(shù)據(jù)庫輸入NM_007678 NM_004642 NM_145918 NM_024504 NM_014847或GI:131886531 GI:394025684 GI:125987604 GI:359718918 GI:188497757（注意每個(gè)之間要加入空格喲）。點(diǎn)擊“Search”后，會(huì)展示5個(gè)基因序列

　　選中1-5，點(diǎn)擊右上角的Send to 下的小三角，出現(xiàn)Choose Destination對(duì)話框，按照下圖進(jìn)行選擇，點(diǎn)擊Create File

序列就DOWN下來了！

　　但是，需要注意的是，下載的序列是個(gè)“復(fù)合體”，5個(gè)序列集合到一起了。

　　看到這里是不是已經(jīng)暈倒了？！

　　不要著急，小編偷偷的告訴你一個(gè)小技巧！

　　選擇合適的軟件，如DNAstar，對(duì)其進(jìn)行打開，把下載的序列FASTA拖到軟件中，會(huì)自動(dòng)識(shí)別5個(gè)序列

　　這樣就大功告成了！

　　在NCBI中還可以對(duì)序列進(jìn)行比對(duì)、設(shè)計(jì)引物等，功能非常強(qiáng)大！

　　以后小編會(huì)為大家逐一進(jìn)行介紹喲！