關(guān)于微基生物

　　微基生物致力于協(xié)助科研人員探索微生態(tài)與健康、生產(chǎn)、環(huán)境之間隱藏的奧秘，更好地利用微生物資源。
　　同時(shí)開展Illumina?Miseq、　Ion PGM及Roche 454二代高通量測(cè)序分析，PacBio第三代高通量測(cè)序分析，PCR-DGGE變性梯度凝膠分析，克隆文庫(kù)等多種微生態(tài)分析方法的公司。公司擁有經(jīng)驗(yàn)豐富的技術(shù)團(tuán)隊(duì)，涉及分子生物學(xué)、醫(yī)學(xué)、生物信息學(xué)、統(tǒng)計(jì)生態(tài)學(xué)方面，核心成員具有10余年一線科研工作經(jīng)驗(yàn)。
　　微基生物已完成300余項(xiàng)微生物多樣性分析項(xiàng)目，分析樣本6000余例。研究對(duì)象涉及糞菌、土壤、水體、發(fā)酵物、腸道、人體微生物等各類樣本。
　　微基生物將繼續(xù)專注微生態(tài)研究，緊跟國(guó)際分子生物學(xué)技術(shù)、生物信息學(xué)、統(tǒng)計(jì)分析技術(shù)發(fā)展，以更好的服務(wù)質(zhì)量，協(xié)助研究者解碼微生物世界的奧秘！

分析案例

　　

案例分析案例：某類細(xì)菌在相關(guān)疾病爆發(fā)過(guò)程中與其他細(xì)菌/真菌的相關(guān)性。

　　分析方法：相關(guān)性分析是用于分析微生物間相互作用關(guān)系的經(jīng)典方法，可甄別出微生 物群落間（包括細(xì)菌、真菌、古細(xì)菌等各類檢測(cè)目標(biāo)）具有顯著相關(guān)性、強(qiáng)相關(guān)、正相關(guān)、負(fù)相關(guān)的各項(xiàng)。

　　

分析案例：? 丁酸鹽產(chǎn)生菌的減少和一些致病微生物的增加使得CRC患者腸道微生物菌落的失衡

　　Tingting Wang等采用高通量測(cè)序技術(shù)研究結(jié)直腸癌（CRC）患者與正常人群腸道微生物的菌落組成差異。并結(jié)合real-time PCR對(duì)相關(guān)基因進(jìn)行分析，最終確定丁酸鹽產(chǎn)生菌的減少和一些致病微生物的增加使得CRC患者腸道微生物菌落的失衡。實(shí)驗(yàn)對(duì)象的數(shù)目：CRC患者46人，健康志愿者56人。

Structural segregation of gut microbiota between colorectal cancer patients and healthy volunteers. 2012.? The ISME Journal

　　

分析案例：服用某中草藥改變腸道菌群，進(jìn)而緩解二型糖尿病

　　腸道菌群對(duì)新陳代謝疾?。ㄈ缍吞悄虿2D）有重要的作用，傳統(tǒng)的中草藥葛根芩連湯（GQD）對(duì)二型糖尿病有緩和作用。
　　為了研究GQD對(duì)T2D的調(diào)節(jié)作用是否通過(guò)改變腸道菌群的組成，Jia Xu等對(duì)187名T2D患者給予不同劑量的GQD（44名給予高劑量，52名給予中劑量，50名給予低劑量，41名給予安慰劑），對(duì)腸道微生物進(jìn)行研究。高劑量和中劑量處理的樣本較低劑量和安慰劑處理的樣本中空腹血糖（FBG）和糖化的血紅蛋白（HbA1c）顯著降低，通過(guò)RDA分析，鑒定出47個(gè)豐富的種，其中17個(gè)與FBG負(fù)相關(guān)，9個(gè)與HbA1c負(fù)相關(guān)。
實(shí)驗(yàn)結(jié)果顯示，中草藥GOD處理可以增加有益微生物的種類，如Faecalibacterium spp。

Structural modulation of gut microbiota during alleviation of type 2 diabetes with a Chinese herbal formula. 2015. The ISME Journal

相關(guān)分析方法：采用網(wǎng)絡(luò)分布圖展示不同個(gè)體或人群的腸道微生物分布，可以形象的展示不同個(gè)體或人群之間的相同物種或是OTU的相似、分布情況。

相關(guān)分析方法： 利用冗余分析（RDA）反映在某微生物分類級(jí)別上（如屬）不同個(gè)體腸道菌群差異與健康、藥物、飲食之間關(guān)系。